生物濾池的投產(chǎn)與活性污泥處理裝置投產(chǎn)相類似，有一個生物膜的培養(yǎng)與馴化的階段。這一階段一方面是使微生物生長、繁殖直到濾料表面長滿生物膜，微生物的數(shù)量滿足污水處理的要求；另一方面則是使微生物能逐漸適應所處理的污水水質(zhì)，即馴化微生物。可先將生活污水投配入濾池，待生物膜形成后（夏季時約2-3周即達成熟）再逐漸加入工業(yè)廢水，或直接將生活污水與工業(yè)廢水的混合液投入濾池或向濾池投配其他廢水處理廠的生物膜或活性污泥等。

當處理工業(yè)廢水時，通常先投20%的工業(yè)廢水量和 80%生活污水量來培養(yǎng)生物膜。當觀察到一定的處理效果時，逐漸加大工業(yè)廢水量和生活污水量的比值，直到全部是工業(yè)廢水時為止。當生物膜的培養(yǎng)與馴化結(jié)束，生物濾池便可按設(shè)計方案正常運行。